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파일을 압축해서 압축 비번을 걸고 풀어서 하라고 하는 방법 외엔 없습니다.
압축파일 암호 걸어주는게 여러 사람에게 나눠 줄 때도 편하겠죠. 그냥 암호 걸린 파일을 USB에 담아주기만 하면 되니까..
된다고 해도 언제 폴더마다 암호 걸어주고 하실려고...
찾아보면 베라크립트 암호입력 같은걸 스크립트로 할 수 있지 않을까 싶습니다.