안녕하세요 연구실에서 바이오인포용 컴퓨터를 새로 맞추게 되어 횐님들께 질문올리게 되었습니다.
현재는 루틴하게 돌리는 데이터의 양이 많지 않아 기존에 있던 데스크탑용 컴퓨터에 램을 많이 달아 쓰고 있었지만 성능을 더 확장한 컴퓨터를 이번에 맞추라는 지시가 내려와 견적을 내보았는데 궁금한 점들이 많아 몇가지 질문 올립니다. 예산은 550만원 내외입니다.
주로 사용하는 tool들의 시스템 권장사항들은 보통 램 사이즈만 언급되고 있습니다.
1. 현재는 윈도우 10의 WSL에서 리눅스용 분석 tool들을 돌리고 있었는데 만약 서버용 컴퓨터를 사용하게 되더라도 윈도우 또는 우분투 데스크탑 같은 데스크탑용 OS를 설치해서 사용해도 사용에 지장이 없는지 질문드립니다.
2. 서버용 컴퓨터 견적을 제 나름대로 내보았는데 부품들간의 호환이 제대로 이루어지는지, 적절한 성능인지 조언해주시면 정말 감사하겠읍니다.
3. 저희 연구실에는 서버용 컴퓨터를 유지,보수 할 인력이 전무하여 과하게 높은 스펙의 컴퓨터를 사는게 너무 과한 투자가 아닌지 걱정되는데 정기적으로 이러한 부분은 외주를 맡기는 것이 가능한지도 질문 드립니다.
컴퓨터에는 거의 문외한이라 송구스럽게 질문을 많이 올리게 되었습니다. 회원님들 정말 감사합니다.
쿨러도 하나 빠졌네요.
연구실이고 업무용이라면 유지보수를 누가 어떻게 할건지도 고민하셔야 합니다. 다나와 출장방문 AS면 부품에 대해서만 보증을 해줄겁니다. PC 한대를 사든 열대를 사든 유지보수 계약을 깔고 들어가던지 해야합니다.
애매하면 벤더 PC로 가는것이 제일 좋겠지요.
2. 브로드웰EP는 이미 단종된지 오래된 제품이고.. 서버시장에서는 스케일러블 gen1이 올해 Q3으로 단종 수순을 밟고 있습니다. 굳이 중고도 아닌데 단종된 걸 저렇게 많은 비용을 들여서 살 필요가 있는 가 싶습니다. 워크스테이션을 도입하는 것이 좋습니다. 이곳 장터를 기웃거려보시면 계산서도 끈어주시는 업자분들이 많기 때문에 굳이 조립을해서 만일에 생길 애프터마켓의 품질에 의한 문제를 조금 줄일 수 있지요.
3.유지보수를 맺기 위해서는 제조사에 기본적인 유지보수 계약을 우선하는 것이 좋은데 저런 브랜드가 없는 pc의 경우는 유지보수를 계약하기도 쉽지도 않고, 또 계약 업자 입장에서도 돈도 크게 안되면서 리스크만 엄청 큰 일이라 양쪽다 쉬워 보이지 않습니다.
문제 생기면 조립한 사람이 들고 뛰어야죠..
요즘 AS 센터는 자기네가 판매한 부품만 AS하지 전체적으로 시스템을 봐주지 않습니다..
보드 AS센터에 CPU 꼽아가도 이렇게 꼽아 오면 안됩니다라고 하고 소비자에게 빼라고 하지요..
(빼다가 고장나면 이것도 문제인지라..)
데이터 양이 많지 않은데 무슨 이유로 새로 맞추려고 하시나요?
현재 사용하는 컴이 불편한 점이 무엇인가요?
이곳 게시판을 조금 눈팅해 보시면 격언을 하나 보실 수 있습니다
"잘 돌아가는 시스템은 건드리지 않는다"
30Gbp 유전체를 처리하는데 32GB면 된다고 하니 de novo assembly는 아닌것 같은데... 나중에 어셈블리까지 하게 될 경우라면 메모리가 발목 잡습니다. 전사체 어셈블리라도 할려고 하면 256GB는 필요합니다. 64GB로 일주일 걸릴게 256GB로 하루면 되요. 그리고 조립해도 되지만, 그냥 다나와 검색하셔서 램슬롯 8개짜리 워크스테이션 깡통 사양으로 구입하고 나중에 필요에 따라 업그레이드 하는게 가성비 좋습니다. 300 만원대로 괜찮게 꾸밀 수 있을겁니다. 그리고 웬만하면 리눅스만 설치해서 쓰세요. 저도 처음엔 가상머신으로 쓰다가, 다음엔 듀얼부팅으로 쓰다가, 결국엔 리눅스만 깔아서 쓰게 되더군요. 첨엔 익숙하지 않아서 유지관리가 대단히 어려운것 같지만, 쓰다보면 그냥 윈도와 비슷합니다. 데이타 백업 열심히 하면 됩니다.
참고로 제 컴 사양은 아래와 같습니다. 우분투 데스크탑 18.04 사용중이구요. 그래픽 카드는 라데온 5450, 6450 입니다. 리눅스엔 라데온이죠.
Asus X79 보드 / E5-1660 / 64GB 일반램 : MSI X99 보드 / E5-2690 V3 / 192GB 일반램
델 T7600 / E5-2690 듀얼 / 256GB 서버램 : 델 T7600 / E5-2689 듀얼 / 256GB 서버램
시간 오래 걸리는 작업이라면 전사체 Trinity 어셈블리, 로칼 BLAST, miRDeep2로 하는 microRNA 예측 정도입니다.